背景簡介
RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀結(jié)合高通量測序的一種技術(shù)，通過免疫沉淀靶蛋白來捕獲互作的RNA。其原理是運用針對目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來，然后經(jīng)過分離純化獲得結(jié)合在復(fù)合物上的RNA，再通過高通量測序?qū)崿F(xiàn)對目的RNA的信息分析。RIP技術(shù)與高通量測序的結(jié)合，能幫助研究人員從全基因組層面了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程。
技術(shù)優(yōu)勢
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多年經(jīng)驗總結(jié)抗體特性，保證高IP成功率
分析流程
分析內(nèi)容
樣本類型
個體較小動物如小鼠、雛雞、斑馬魚等肝臟、心臟、腦等組織>1g；
個體較大動物如豬、牛、羊等肌肉、晚期胚胎等組織>2g，脂肪組織>10g；
昆蟲等整只個體>3g；
腫瘤組織>1g；
植物組織：果實>10g，花序、花蕊、花粉>2g，其他部位>5g；
細(xì)胞樣本>1×108個
Peak 在基因功能元件上的分布
peak 以及周邊基因結(jié)構(gòu)的可視化
motif 分析
